สำนักงานรัฐมนตรี สำนักงานปลัดกระทรวงยุติธรรม กรมควบคุมประพฤติ กรมคุ้มครองสิทธิและเสรีภาพ กรมบังคับคดี กรมพินิจและคุ้มครองเด็กและเยาวชน กรมราชทัณฑ์ กรมสอบสวนคดีพิเศษ สำนักงานกิจการยุติธรรม สถาบันนิติวิทยาศาสตร์

ส่วนราชการในสังกัดกระทรวงยุติธรรมที่ขึ้นตรงต่อรัฐมนตรี สำนักงานคณะกรรมการป้องกันและปราบปรามยาเสพติด

ส่วนราชการที่ไม่สังกัดกระทรวงยุติธรรมแต่อยู่ในกำกับดูแล สำนักงานอัยการสูงสุด สำนักงาน ปปง.